Un Secrétariat Général du Parquet Général est assuré par un substitut général qui effectue les liaisons avec le Secrétariat Général de la Première Présidence et le Service Administratif Régional.
Dans ce cadre, ce magistrat suit les questions intéressant le fonctionnement de la Cour et des juridictions du ressort, leurs équipements notamment dans le domaine informatique et celles relatives à la gestion des personnels.

Ce magistrat a également la charge du suivi et du développement du réseau Intranet de la Justice au sein de la Cour d'Appel et du site internet de la Cour. En outre, il centralise, exploite et procède au suivi des statistiques pénales générales et des tableaux de bord d'activité des Parquets du ressort de la Cour.